データベース

データベース概要

淀川流域植物情報統合データベース（YRPID: Yodo River Plant Information Database）は、1998年から蓄積された26年間の調査データを統合した、日本最大級の流域植物データベースである。標本情報・分布情報・生態情報・画像情報・分子情報を一元管理し、研究者・行政・市民への情報提供を行う。FAIR原則（Findable, Accessible, Interoperable, Reusable）に基づくデータ公開により、国内外の研究促進に貢献している。

システム特徴

• 多言語対応: 日本語・英語・中国語での情報提供
• マルチデバイス: PC・タブレット・スマートフォン対応
• リアルタイム更新: 新規データの即時反映
• 高速検索: インデックス最適化による秒間応答
• GIS統合: 地図ベースでの直感的操作

データ構造と標準化

1. データモデル設計

2. 標準化と互換性

3. データ品質基準

検索・閲覧システム

1. 検索機能

2. 表示オプション

3. 詳細情報表示

種別詳細ページでは、分類情報・形態特徴・生態情報・分布状況・保全状況・文献情報を包括的に表示。関連種・類似種へのリンク、観察記録の時系列表示、高解像度画像の閲覧が可能。

収録データタイプ

1. 分類・命名情報

2. 分布・観察情報

3. 画像・メディア情報

4. 分子・遺伝情報

• DNA配列: 核・葉緑体・ミトコンドリアゲノム
• 系統樹: 分子系統・分岐年代・祖先復元
• 集団遺伝: 遺伝的多様性・構造・分化
• バーコード: 種判別用DNA配列

API・Web サービス

1. REST API

2. データフォーマット

3. 利用認証・制限

4. 外部システム連携

• GBIF: 地球規模生物多様性情報ファシリティ
• S-Net: サイエンスネットワーク標本データベース
• BG-Plants: 植物園植物情報データベース
• 国際DNA銀行: 分子情報の相互参照

データ品質管理

1. 品質評価システム

2. 専門家検証

3. 信頼度ランキング

観察者の経験・専門性、記録の詳細度、証拠の有無等に基づく5段階の信頼度評価システム。ユーザーは信頼度に応じてデータの利用可否を判断可能。

オープンデータ政策

1. ライセンス体系

2. データ提供方針

3. データ引用・謝辞

4. 利用促進活動

• ワークショップ: データ利用方法の講習会
• ハッカソン: アプリ開発イベント
• コンテスト: データ活用アイデア募集
• 教育支援: 学校教育での利用促進